Um dos primeiros grandes desafios da ciência Química foi desvendar a estrutura da matéria. Apesar do assunto já ter sido explorado por alguns filósofos como Demócrito, Leucipo, Aristóteles, entre outros, Dalton foi a precursor dos modelos atômicos. Porém, no método científico, cada modelo é válido até que alguma evidência experimental o derrube. Associe cada modelo com um, ou mais fatos que o levaram a ser abandonados e/ou complementados.​